Los modelos de equilibrio general computable han sido el principal instrumento para el análisis de los efectos del ALCA sobre las economías del MERCOSUR. Se distinguen modelos estáticos con competencia perfecta, estáticos con competencia imperfecta y dinámicos. A su vez, se dividen entre aquellos que consideran o no economías externas asociadas al comercio exterior. Por otra parte, los modelos aplicados se diferencian según la consideración o no de las preferencias comerciales en acuerdos de ALADI, SGP u otros mecanismos de comercio preferencial, así como por el nivel de las elasticidades de sustitución entre bienes domésticos e importados en la calibración del modelo.

Los modelos adoptados en la mayor parte de los trabajos relevados se inscriben en la primera categoría -modelos con competencia perfecta- y coinciden en estimar que los impactos del ALCA sobre el bienestar de los países del MERCOSUR serían pequeños, positivos para los participantes y muy pequeños para el resto. Su principal impacto sería sobre el comercio exterior. Aun cuando las pérdidas o ganancias globales serían pequeñas, al cambiar los patrones de comercio y especialización habría ganadores y perdedores, lo que generaría problemas de economía política. Los trabajos que asumen una fuerte elasticidad de sustitución entre productos domésticos e importados encuentran impactos mayores pero la principal fuente de variación en los resultados encontrados parece ser la consideración de externalidades tecnológicas asociadas al comercio exterior. Ambos aspectos deberían ser más estudiados para mejorar su calibración.